اعتمد التقرير على التحليل القانوني لمواد الدستور والقانون ولائحة تنظيم السجون في مصر، كما اعتمد التقرير على المعايير الدولية ذات الصلة بأوضاع السجناء. واستخدم التقرير البيانات الصادرة عن النيابة العامة المصرية بشأن وفاة شادي حبش، إلى جانب بعض تقارير منظمات حقوقية مصرية، تناولت أوضاع الرعاية الصحية في السجون. وحصل مُعِدُّ التقرير على عدد من الشهادات من سجناء سابقين.
